MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thauera sp. MZ1T plasmid pTha01

Total Repeats: 1354

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011667	AAG	2	6	30	35	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217980116
2	NC_011667	TCG	2	6	144	149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217980116
3	NC_011667	GC	4	8	206	213	0 %	0 %	50 %	50 %	217980116
4	NC_011667	CGC	2	6	265	270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	217980116
5	NC_011667	GCGTGC	2	12	274	285	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	217980116
6	NC_011667	TCG	2	6	356	361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217980117
7	NC_011667	TGC	3	9	375	383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217980117
8	NC_011667	GGC	2	6	408	413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217980117
9	NC_011667	TCC	2	6	424	429	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	217980117
10	NC_011667	CG	3	6	467	472	0 %	0 %	50 %	50 %	217980117
11	NC_011667	GTG	2	6	541	546	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	217980117
12	NC_011667	GC	3	6	553	558	0 %	0 %	50 %	50 %	217980117
13	NC_011667	GCC	2	6	564	569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	217980117
14	NC_011667	TGC	2	6	570	575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217980117
15	NC_011667	TGA	2	6	582	587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217980117
16	NC_011667	GTC	2	6	681	686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217980118
17	NC_011667	C	6	6	706	711	0 %	0 %	0 %	100 %	217980118
18	NC_011667	GCG	2	6	713	718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217980118
19	NC_011667	GCG	2	6	803	808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217980118
20	NC_011667	TCC	2	6	880	885	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	217980118
21	NC_011667	GCT	2	6	953	958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217980118
22	NC_011667	CTT	2	6	996	1001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217980118
23	NC_011667	ACC	2	6	1198	1203	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	217980119
24	NC_011667	CGC	2	6	1223	1228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	217980119
25	NC_011667	CT	3	6	1239	1244	0 %	50 %	0 %	50 %	217980119
26	NC_011667	ACA	2	6	1366	1371	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217980119
27	NC_011667	GCAC	2	8	1383	1390	25 %	0 %	25 %	50 %	217980119
28	NC_011667	GAAT	2	8	2482	2489	50 %	25 %	25 %	0 %	217980120
29	NC_011667	TGGC	2	8	2546	2553	0 %	25 %	50 %	25 %	217980120
30	NC_011667	GCT	2	6	2573	2578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217980120
31	NC_011667	CA	4	8	2592	2599	50 %	0 %	0 %	50 %	217980120
32	NC_011667	GA	3	6	2614	2619	50 %	0 %	50 %	0 %	217980120
33	NC_011667	GGC	2	6	2636	2641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217980120
34	NC_011667	CCCG	2	8	2659	2666	0 %	0 %	25 %	75 %	217980120
35	NC_011667	GTG	2	6	2801	2806	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	217980120
36	NC_011667	TTGCT	2	10	2836	2845	0 %	60 %	20 %	20 %	217980120
37	NC_011667	CCA	2	6	2931	2936	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	217980120
38	NC_011667	TCT	2	6	2950	2955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217980120
39	NC_011667	GAT	2	6	3074	3079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217980120
40	NC_011667	CGGA	2	8	3088	3095	25 %	0 %	50 %	25 %	217980120
41	NC_011667	CGA	2	6	3101	3106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217980120
42	NC_011667	ATC	2	6	3124	3129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217980120
43	NC_011667	GT	3	6	3180	3185	0 %	50 %	50 %	0 %	217980120
44	NC_011667	GTC	2	6	3237	3242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217980120
45	NC_011667	CG	3	6	3250	3255	0 %	0 %	50 %	50 %	217980120
46	NC_011667	AGC	2	6	3265	3270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217980120
47	NC_011667	GGC	2	6	3321	3326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217980120
48	NC_011667	A	7	7	3367	3373	100 %	0 %	0 %	0 %	217980120
49	NC_011667	AC	4	8	3403	3410	50 %	0 %	0 %	50 %	217980120
50	NC_011667	CTG	2	6	3469	3474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217980120
51	NC_011667	GGA	2	6	3476	3481	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	217980120
52	NC_011667	GGC	2	6	3488	3493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217980120
53	NC_011667	G	6	6	3505	3510	0 %	0 %	100 %	0 %	217980120
54	NC_011667	TGGG	2	8	3909	3916	0 %	25 %	75 %	0 %	217980121
55	NC_011667	CAG	2	6	3950	3955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217980121
56	NC_011667	CAT	2	6	3977	3982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217980121
57	NC_011667	ACCG	2	8	4155	4162	25 %	0 %	25 %	50 %	217980121
58	NC_011667	GC	3	6	4169	4174	0 %	0 %	50 %	50 %	217980121
59	NC_011667	ACC	2	6	4386	4391	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	217980121
60	NC_011667	CG	3	6	4462	4467	0 %	0 %	50 %	50 %	217980122
61	NC_011667	GCA	2	6	4491	4496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217980122
62	NC_011667	GCTC	2	8	4524	4531	0 %	25 %	25 %	50 %	217980122
63	NC_011667	ACC	2	6	4543	4548	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	217980122
64	NC_011667	CATGC	2	10	4591	4600	20 %	20 %	20 %	40 %	217980122
65	NC_011667	GAG	2	6	4631	4636	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	217980122
66	NC_011667	TCA	2	6	4688	4693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217980123
67	NC_011667	GC	3	6	4725	4730	0 %	0 %	50 %	50 %	217980123
68	NC_011667	TCA	2	6	4744	4749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217980123
69	NC_011667	CTG	3	9	4793	4801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217980123
70	NC_011667	CGC	2	6	4855	4860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	217980123
71	NC_011667	GCG	2	6	4927	4932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217980123
72	NC_011667	GCG	2	6	4946	4951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217980123
73	NC_011667	CG	3	6	4950	4955	0 %	0 %	50 %	50 %	217980123
74	NC_011667	GGC	2	6	5005	5010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217980123
75	NC_011667	GC	3	6	5056	5061	0 %	0 %	50 %	50 %	217980123
76	NC_011667	CGG	2	6	5095	5100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217980123
77	NC_011667	AGC	2	6	5142	5147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217980123
78	NC_011667	CGA	2	6	5179	5184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217980123
79	NC_011667	CGT	2	6	5191	5196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217980123
80	NC_011667	CCG	2	6	5299	5304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	217980124
81	NC_011667	CG	3	6	5374	5379	0 %	0 %	50 %	50 %	217980124
82	NC_011667	CG	3	6	5389	5394	0 %	0 %	50 %	50 %	217980124
83	NC_011667	GCG	3	9	5392	5400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217980124
84	NC_011667	CTTC	2	8	5402	5409	0 %	50 %	0 %	50 %	217980124
85	NC_011667	CTT	2	6	5477	5482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217980124
86	NC_011667	CCTTCG	2	12	5519	5530	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	217980124
87	NC_011667	GCC	2	6	5566	5571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	217980124
88	NC_011667	CGC	2	6	5585	5590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	217980124
89	NC_011667	GC	3	6	5589	5594	0 %	0 %	50 %	50 %	217980124
90	NC_011667	GGT	2	6	5733	5738	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	217980124
91	NC_011667	GC	3	6	5755	5760	0 %	0 %	50 %	50 %	217980124
92	NC_011667	TCG	2	6	5773	5778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217980124
93	NC_011667	CGC	2	6	5808	5813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	217980124
94	NC_011667	CG	3	6	5819	5824	0 %	0 %	50 %	50 %	217980124
95	NC_011667	CGG	2	6	5870	5875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217980124
96	NC_011667	TTGGCC	2	12	6019	6030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217980124
97	NC_011667	ACC	2	6	6031	6036	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	217980124
98	NC_011667	GCC	2	6	6061	6066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	217980124
99	NC_011667	GCC	3	9	6080	6088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	217980124
100	NC_011667	CGC	2	6	6099	6104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	217980124
101	NC_011667	CGC	2	6	6108	6113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	217980124
102	NC_011667	GGC	2	6	6134	6139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217980124
103	NC_011667	GCCG	2	8	6167	6174	0 %	0 %	50 %	50 %	217980124
104	NC_011667	TTC	2	6	6177	6182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217980124
105	NC_011667	CGC	2	6	6195	6200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	217980124
106	NC_011667	CGC	2	6	6492	6497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	217980125
107	NC_011667	GCC	2	6	6502	6507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	217980125
108	NC_011667	CGG	3	9	6542	6550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217980125
109	NC_011667	CCA	2	6	6570	6575	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	217980125
110	NC_011667	AGCG	2	8	6708	6715	25 %	0 %	50 %	25 %	217980125
111	NC_011667	GGAT	2	8	6736	6743	25 %	25 %	50 %	0 %	217980125
112	NC_011667	GCT	2	6	6752	6757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217980125
113	NC_011667	GCC	3	9	6759	6767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	217980125
114	NC_011667	CGG	2	6	6826	6831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217980125
115	NC_011667	CGC	2	6	6837	6842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	217980125
116	NC_011667	CGAC	2	8	6863	6870	25 %	0 %	25 %	50 %	217980125
117	NC_011667	CGC	2	6	6872	6877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	217980125
118	NC_011667	GC	3	6	6876	6881	0 %	0 %	50 %	50 %	217980125
119	NC_011667	TGA	2	6	6884	6889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217980125
120	NC_011667	ACG	2	6	6920	6925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217980125
121	NC_011667	CAC	2	6	6981	6986	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	217980125
122	NC_011667	GACCG	2	10	7074	7083	20 %	0 %	40 %	40 %	217980125
123	NC_011667	GCT	2	6	7300	7305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217980126
124	NC_011667	CCCAG	2	10	7341	7350	20 %	0 %	20 %	60 %	217980126
125	NC_011667	TGGCCA	2	12	7388	7399	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	217980126
126	NC_011667	CGC	2	6	7411	7416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	217980126
127	NC_011667	GCC	2	6	7451	7456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	217980126
128	NC_011667	TGC	2	6	7490	7495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217980126
129	NC_011667	GAA	2	6	7531	7536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217980126
130	NC_011667	CGG	2	6	7592	7597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217980126
131	NC_011667	GCC	2	6	7807	7812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	217980126
132	NC_011667	GCGCG	2	10	7888	7897	0 %	0 %	60 %	40 %	217980126
133	NC_011667	CAG	2	6	7909	7914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217980126
134	NC_011667	CCG	2	6	7947	7952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	217980126
135	NC_011667	CAG	2	6	7996	8001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217980126
136	NC_011667	GAC	2	6	8041	8046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217980126
137	NC_011667	CTG	2	6	8105	8110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217980126
138	NC_011667	TGC	2	6	8148	8153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217980126
139	NC_011667	CGA	2	6	8176	8181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217980126
140	NC_011667	GTG	2	6	8186	8191	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	217980126
141	NC_011667	CAGC	2	8	8244	8251	25 %	0 %	25 %	50 %	217980126
142	NC_011667	GCCAG	2	10	8292	8301	20 %	0 %	40 %	40 %	217980126
143	NC_011667	CAG	3	9	8380	8388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217980126
144	NC_011667	CAG	3	9	8464	8472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217980126
145	NC_011667	ATC	2	6	8498	8503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217980126
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147	NC_011667	TGA	2	6	8580	8585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217980126
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149	NC_011667	AGCGC	2	10	8802	8811	20 %	0 %	40 %	40 %	217980126
150	NC_011667	TTC	2	6	8813	8818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217980126
151	NC_011667	GTA	2	6	8842	8847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217980126
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153	NC_011667	TGA	2	6	8898	8903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217980126
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155	NC_011667	CGG	2	6	8919	8924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217980126
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158	NC_011667	CGATG	2	10	9066	9075	20 %	20 %	40 %	20 %	217980126
159	NC_011667	GGC	2	6	9163	9168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217980126
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161	NC_011667	GGC	2	6	9289	9294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217980126
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165	NC_011667	ACG	2	6	9391	9396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217980126
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169	NC_011667	GCCAG	2	10	9582	9591	20 %	0 %	40 %	40 %	217980126
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259	NC_011667	TGCG	2	8	16311	16318	0 %	25 %	50 %	25 %	217980132
260	NC_011667	CGG	2	6	16321	16326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217980132
261	NC_011667	GC	3	6	16404	16409	0 %	0 %	50 %	50 %	217980132
262	NC_011667	CGT	2	6	16432	16437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217980132
263	NC_011667	GCG	2	6	16451	16456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217980132
264	NC_011667	GAG	2	6	16475	16480	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	217980132
265	NC_011667	GCG	2	6	16496	16501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217980132
266	NC_011667	AAG	2	6	16529	16534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217980132
267	NC_011667	CG	3	6	16586	16591	0 %	0 %	50 %	50 %	217980132
268	NC_011667	GC	3	6	16635	16640	0 %	0 %	50 %	50 %	217980132
269	NC_011667	GGC	2	6	16647	16652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217980132
270	NC_011667	GC	3	6	16685	16690	0 %	0 %	50 %	50 %	217980132
271	NC_011667	GGC	2	6	16780	16785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217980132
272	NC_011667	CGT	2	6	16810	16815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217980132
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279	NC_011667	AGTA	2	8	18466	18473	50 %	25 %	25 %	0 %	217980133
280	NC_011667	GCA	2	6	18867	18872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217980134
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303	NC_011667	GCA	2	6	19834	19839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217980134
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380	NC_011667	T	6	6	24086	24091	0 %	100 %	0 %	0 %	217980139
381	NC_011667	GGCGA	2	10	24134	24143	20 %	0 %	60 %	20 %	217980139
382	NC_011667	ACC	2	6	24164	24169	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	217980139
383	NC_011667	GCG	2	6	24179	24184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217980139
384	NC_011667	TGG	2	6	24233	24238	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	217980139
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387	NC_011667	GCG	2	6	24311	24316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217980139
388	NC_011667	ACG	2	6	24351	24356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217980139
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391	NC_011667	CGC	2	6	24757	24762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	217980140
392	NC_011667	CCG	2	6	24765	24770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	217980140
393	NC_011667	GCC	2	6	24786	24791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	217980140
394	NC_011667	GGC	2	6	24805	24810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217980140
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400	NC_011667	GC	3	6	25237	25242	0 %	0 %	50 %	50 %	217980140
401	NC_011667	GC	3	6	25252	25257	0 %	0 %	50 %	50 %	217980140
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424	NC_011667	TGC	2	6	25958	25963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217980141
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498	NC_011667	GC	3	6	28717	28722	0 %	0 %	50 %	50 %	217980146
499	NC_011667	GTC	4	12	28766	28777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217980146
500	NC_011667	CAC	2	6	28798	28803	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	217980146

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